挑战因子是每日随机生成的特殊游戏规则，能够显著改变游戏体验和难度。玩家可以通过警官NPC处消耗蓝币刷新因子，每天最多可领取一次挑战奖励。因子分为正面和负面效果，合理利用因子组合能够提升通关效率，但需注意极端困难或容易的组合不会出现在随机结果中。部分特殊因子如随机更换角色需要通过特定方式应对，例如暂停查看角色技能或直接进入下一关刷新角色。
因子之战作为元气骑士的核心玩法之一，需要玩家根据因子特性调整战术策略。面对敌人子弹速度增加等负面因子时，优先选择具有防御技能的角色如圣骑士；遇到技能冷却时间减半等正面因子则可搭配高爆发技能角色。地形利用和团队协作在因子之战中尤为重要，障碍物和陷阱能有效规避敌人攻击，而多人模式下需保持沟通以优化资源分配。部分因子如护盾不再自动回复会极大改变游戏节奏，携带恢复类武器或选择牧师角色更为稳妥。
近战角色在只能携带一把武器的因子下可搭配骑士一技能实现双持，远程角色则优先选择高射速或追踪类武器应对敌人瞬移因子。饰品搭配需注重属性互补，攻击型因子可强化输出，防御型因子则提升生存能力。死亡笔记等特殊武器对部分因子有奇效，但需注意其对BOSS无效的限制。武器升级和芯片精炼能有效抵消负面因子带来的劣势。
玩家可通过多种方式获取和刷新因子。单人模式下每日自动刷新任务展板，完成挑战可获得因子；地牢中遇到警官或气宗NPC也会提供随机因子。修改系统时间可强制刷新因子，但可能触发每日奖励BUG。联机模式下可手动设置挑战因子选项，隐藏关卡则能解锁特殊因子。生命值固定为1的因子要求绝对规避伤害，可搭配无敌帧技能；天赋位置减少需精简核心天赋；敌人防御增加则需破防武器或高暴击build。部分因子存在相互作用，如敌人更密集配合范围伤害技能可快速清场。掌握每种因子的运作机制和应对方案，是提升通关稳定性的关键。
