游戏的主线剧情将劳拉带到了苏联设施区域，故事从越狱开始。走到墙边掰断水管破开牢房的墙壁，钻到隔壁房间在桌子上找到全新的反曲弓和绳索装备。返回牢房，用绳索箭矢拉开牢门上方的木板找到出口爬出去。打开柜子拿回自己的装备后，帮助隔壁熟悉地形的男子打开牢门并给他手台，准备一同越狱。下楼后通过房间的幻灯片了解这座劳改营的历史。离开牢房建筑后，劳拉在附近找到一座营地。在路上会遇到敌人，此时需要学习扔瓶子技能来吸引敌人的注意力，将聚在一起的敌人分散开以便逐个进行暗杀处理。在院落中对付多名敌人时，可以合理利用此技巧。
跟随主线来到铜矿工厂，在开始处可以找到铜矿工厂桥梁营地，并从旁边箱子里拿到新装备宽头攀爬箭矢。这种箭矢可以射入软木表面作为攀爬的依靠点。朝营地旁边的软木墙壁射宽头箭需要蓄力，利用它爬上平台后滑索道下去。遇到栈桥断掉的情况，需要用多支宽头箭搭路才能跳到对面。根据指引，古墓的入口通常在铜矿工厂的上层。由上方的平台跳下去，用控制台打开沉重的铁门，沿着矿坑通道走下去。走到坑道末端滑索道下去，来到下层被水淹没的矿坑，遇到岔路选择右边通道前进。需要拾取环境中的瓶子和布料制作燃烧瓶，烧开前面的障碍物。
继续前进时，攀住木板会触发一辆矿车滑下，迫使劳拉顺着坡道滑落。来到下层坑道的房间后，需要解开利用矿车阻挡水流的谜题。制作燃烧瓶，从泄露的水管上方扔到对面的白布上烧开障碍。由左侧通道下去找到挖掘坑道营地，然后跳到洞腹的对岸。进入下方房间后，跳到悬吊的吊斗上使轨道上的矿车坠落，通过调整矿车的位置来挡住上方的水流，从而开辟新的前进路径。
完成工厂内的探索后，劳拉会经历一段紧张的冰面逃亡。头顶的水面结着厚冰，需要快速朝前方透出微光的冰洞游过去。爬上冰面后，敌机会出现并朝冰湖疯狂扫射，此时需要快速沿冰面奔跑跳跃。接着沿冰河右岸的平台奔跑，跳上索道滑到冰河左岸。在这段逃亡过程中，劳拉会陷入回忆，想起童年时父亲在办公室饮弹自尽的场景，并道出自己寻找神圣之源的真正原因是为了证明父亲研究的价值。
