重型战机在舰队中承担核心输出任务，其使用需围绕生存能力与火力最大化展开。这类战机通常具备高额单发伤害和特殊攻击模式，但机动性较差且易受防空火力针对，因此部署时必须依赖护航编队保护。维塔斯B010等能量伤害型战机可无视护甲减免，对大型舰船具备毁灭性压制力；而刺鳐等鱼雷轰炸机则擅长隐身突袭和子系统破坏。实战中需将其置于航母或战列巡洋舰的后排机库，通过护航艇、战斗机组成防空网阻截敌方拦截单位，避免重型战机过早暴露在火力范围内。
优先投入技术值缩短武器锁定时间和冷却周期，例如维塔斯B010的等离子轰炸系统需强化单发伤害与暴击率，刺鳐则重点提升鱼雷命中精度及攻城伤害。动力系统建议选择缩短索敌时间的模块，装甲系统则根据战场环境调整：若敌方防空火力密集，可强化闪避率或抵抗伤害；若需持久作战，则提升结构值。需注意重型战机技术树消耗较大，应避免分散投入资源。
每支重型战机编队需搭配侦察机提供电子干扰掩护，降低被导弹锁定的概率；同时配置孢子等专业防空战斗机应对敌方护航艇。舰队中建议配备AC721等防空驱逐舰作为第二层防护，其区域防空导弹能有效拦截袭向机群的远程火力。当遭遇敌方航母体系时，可调动侦察机干扰对方舰载机起降，为重型战机创造输出窗口。
攻城战中优先派遣刺鳐等携带攻城鱼雷的单位摧毁基地模块；舰队决战则让维塔斯B010针对战列巡洋舰进行定点清除。突袭行动可运用刺鳐的隐身特性绕开前线直击后勤舰船，但需规避防空密集区域。若敌方采用小船海战术，应及时撤回重型战机避免被护航艇集火，转而由林鸮等多功能战机接替作战。
