稀有鱼是指分布在各个开放平原水域中，相比普通鱼类更为罕见、捕获条件更苛刻，并且通常是制作高级装备、战甲或换取声望关键材料的特殊鱼类。它们并非单纯的收集品，而是游戏进程中的重要资源，例如用于制作增幅器部件、殁世机甲或各种集团声望物品。
地球的夜灵平原是玩家最早接触也是基础稀有鱼种类最集中的区域，这里共有六种公认的稀有鱼。它们包括鲨客、阴暗鳐、卡其那、盖拉佩德、诺格和克苏尔。这些鱼类的活动规律具有明显差异，鲨客、阴暗鳐和卡其那在全天任何时间都可能在海岸区域出现；而诺格、克苏尔和盖拉佩德则具有严格的夜行性，只会在平原进入夜晚时段后才变得活跃。在地点偏好上，诺格只出现在湖泊水域，克苏尔则只栖息在池塘，其余四种稀有鱼的主要活动范围均在海岸线附近。捕获它们必须使用对应的专用鱼饵，并搭配有效的鱼叉类型。
除了地球，金星奥布山谷和火卫二魔胎之境也拥有各自独特的稀有鱼体系。金星奥布山谷的稀有鱼主要包括多目鳗、重筑虾和海龙，其中多目鳗出现在地表池塘且仅在寒冷天气下出没，重筑虾和海龙则栖息于洞穴内的水池中。火卫二的环境更为特殊，其稀有鱼如独角米索鳎、水肺、璃化脊鳎等，它们的出现与星球独特的Fass-Vome双龙周期紧密绑定。水肺只在Vome时段于地表外分泌液热点出现，而璃化脊鳎也严格遵循Vome光照周期。魔胎之境还存在如三尾额叶鲤、须腔棘鱼等受周期影响的新增稀有鱼种。
成功捕获稀有鱼需要系统的准备和正确的技巧。首要条件是获取对应的钓鱼工具，玩家需要从相应平原的商人处兑换基础的鱼叉，例如地球的兰佐、图洛克和佩拉姆鱼叉。针对火卫二的感染水体，则必须使用女儿处购买的特制鱼叉，普通鱼叉无法生效。其次是鱼饵的针对性使用，每一种稀有鱼都有其专属鱼饵，投放鱼饵后保持适当距离观察水面波纹是通用的引鱼方法。利用光亮染料提高水域能见度，尤其在夜晚或火卫二洞穴等昏暗环境，能显著提升发现鱼群的效率。
